Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Q8BPC6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BPC6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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