Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms