Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms