Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me3Q8BMF3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me3Q8BMF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms