Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smarcal1Q8BJL0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms