Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg4dQ8BGV9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg4dQ8BGV9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg4dQ8BGV9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg4dQ8BGV9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg4dQ8BGV9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4dQ8BGV9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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