Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp4f39Q8BGU0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms