Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg4bQ8BGE6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg4bQ8BGE6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms