Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms