Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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