Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClspnQ80YR7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms