Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8Q80YR6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms