Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnupnQ80W37 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnupnQ80W37 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms