Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnma8aQ80VM8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms