Protein–RNA interactions for Protein: Q80VK6

Arhgef38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef38Q80VK6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Arhgef38Q80VK6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef38Q80VK6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef38Q80VK6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef38Q80VK6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef38Q80VK6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef38Q80VK6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef38Q80VK6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Arhgef38Q80VK6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef38Q80VK6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef38Q80VK6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef38Q80VK6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arhgef38Q80VK6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef38Q80VK6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms