Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp8Q80U87 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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