Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms