Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgo2Q7TSY8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms