Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms