Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms