Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh8Q7TSK3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcdh8Q7TSK3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms