Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms