Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms