Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms