Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vma21Q78T54 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vma21Q78T54 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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