Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ubfd1Q78JW9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ubfd1Q78JW9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ubfd1Q78JW9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubfd1Q78JW9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubfd1Q78JW9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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