Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms