Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf4Q6PFF0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms