Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms