Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms