Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PdgfrlQ6PE55 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms