Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms