Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx6Q6P8X1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx6Q6P8X1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx6Q6P8X1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx6Q6P8X1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms