Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms