Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrimpolQ6P1E7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms