Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4Q6P1D7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms