Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms