Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms