Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HelbQ6NVF4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HelbQ6NVF4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms