Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms