Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retreg2Q6NS82 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retreg2Q6NS82 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms