Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc66Q6NS45 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms