Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms