Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms