Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms