Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc1Q69ZZ6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms