Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sv2cQ69ZS6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sv2cQ69ZS6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sv2cQ69ZS6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sv2cQ69ZS6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sv2cQ69ZS6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sv2cQ69ZS6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms