Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms