Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q66JV7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q66JV7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q66JV7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q66JV7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q66JV7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q66JV7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q66JV7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms