Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Top2bQ64511 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Top2bQ64511 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms